Considerado como uno de los grandes pintores de la Escuela de París, Pedro Flores inicia sus estudios pictóricos en la Real Sociedad Económica de Amigos del País y en el Círculo de Bellas Artes. Muy pronto, establece contacto con los pintores Garay y Ramón Gaya y el escultor José Planes y comienzan sus primeras exposiciones individuales. Su primera etapa está teñida por los aspectos de la pintura naturalista que, poco a poco, va olvidando para adentrarse en los ecos del post-cubismo y el neoclasicismo picassiano.

En 1928, gracias a una beca de la Diputación, viaja a París donde se establece hasta 1933. Allí junto a sus amigos Garay y Gaya realiza una exposición en la famosa Galerie des Quatre Chemins. Dos años más tarde, las Galerías Dalmau acogen una muestra individual cuyo catálogo está prologado por el crítico de arte Sebastià Gasch. El trienio, 1933 -1936, lo pasa impartiendo clases en el Instituto Balmes de Barcelona. Forma parte de la Sociedad de Artistas Ibéricos en sus exposiciones de Copenhague (1932), Berlín (1932) y París (1936). En 1937 es uno de los participantes del Pabellón de la República en la Exposición Internacional de París. Tras ésta, vuelve a instalarse en París.

Su pintura cambia por completo, tanto en temática como en composición. De vital importancia para Pedro Flores es la utilización de los tonos oscuros, sobre todo, el negro que le acercan a la pintura de Goya o Solana. Para la crítica francesa y en especial Jean Cassou dijo del pintor: "Pedro Flores es a la pintura moderna española, lo que es a la poesía moderna española, Federico García Lorca". Desaparece el aspecto optimista y alegre de otras composiciones dando paso a melancólicos paisajes portuarios s o a lánguidas bailarinas.

Su obra está representada en las colecciones más importantes europeas y americanas como el Museo de Arte Moderno de París o en el Museo de Bellas Artes de Puerto Rico.